A Santa Casa da Misericórdia de Benedita deve a sua fundação ao Rev. Padre Francisco Cosme que, após ter consultado o Conselho Pastoral Paroquial, do qual recebeu o parecer unânime, e de ter recebido o apoio da população, concretizado em 317 inscrições de Irmãos Fundadores, requereu ao Eminentíssimo Senhor D. António Ribeiro, Cardeal Patriarca de Lisboa a aprovação do Compromisso da Irmandade da Misericórdia, a qual foi concedida em 6 de Junho de 1993.

No ano de 1993, a Instituição foi dirigida pela Comissão Instaladora eleita pelos Irmãos, e a esta Comissão, coube o arranque necessário para estruturar os serviços.

No dia 6 de Junho de 1993 foi comemorada festivamente a inauguração oficial da Misericórdia, que contou com a presença de várias entidades oficiais, entre as quais a Exma. Direção do C.R.S.S. de Leiria, com quem a Comissão Instaladora da Santa Casa já tinha encetado conversações, para poder dar início aos serviços que desejava prestar.

Em Dezembro deste mesmo ano realizaram-se eleições para os corpos sociais da Instituição, tendo sido eleito para Provedor, o Sr. Dr. José Gonçalves Sapinho.

O Serviço de Apoio Domiciliário, iniciou em Dezembro de 1994, inteiramente sob a responsabilidade da Mesa Administrativa, tendo tido em 1995 os apoios do C.R.S.S. de Leiria, com a celebração do primeiro Protocolo de Acordo e do Centro de Emprego de Alcobaça, para a colaboração nos custos salariais de algumas colaboradoras.

E os apoios continuaram: a Igreja disponibilizou o terreno necessário à construção do Edifício para o Lar; a Precobel ofereceu todo o trabalho de Arquitetura e Engenharia, dirigiu o processo conducente ao concurso Público e adjudicação da empreitada e fiscalizou e acompanhou a construção; o grupo do Clube de Ciclismo organizou várias provas a favor da Misericórdia; os lucros das festas dos Padroeiros durante alguns anos reverteram para a Misericórdia e várias ofertas particulares para mobilar o Lar.

Em 6 de Junho de 1998, 5.º aniversário da fundação da Misericórdia, foi solenemente inaugurado por Sua Excelência Reverendíssima o Senhor D. José Policarpo, Patriarca de Lisboa, o Lar de Idosos e o Centro de Dia Nossa Senhora da Encarnação.